عیسی کلانتری زاده ۱۳۳۱ در شهر مرند است. او تحصیلات کارشناسی زراعت، اصلاح نباتات - دانشکده کشاورزی را بین ۱۳۵۰ تا ۱۳۵۴ در دانشگاه ارومیه، فوق لیسانس فیزیولوژی زراعی را در دانشگاه نبراسکا و دکتری فیزیولوژی و بیوشیمی محصولات زراعی را در ۱۳۵۷–۱۳۶۰ (۱۹۷۸–۱۹۸۱) در دانشگاه ایالتی آیوا آمریکا طی کرد. او به‌عنوان معاون رئیس‌جمهور و رئیس سازمان حفاظت محیط زیست در دولت دوازدهم فعالیت می‌کرد. او همچنین مشاور معاون اول رئیس‌جمهور در امور آب، کشاورزی و محیط زیست، در دولت‌های یازدهم و دوازدهم بوده است. او در دولت‌های مختلف بیش از ۱۲ سال وزیر کشاورزی ایران بود. وزیر کشاورزی در سال پایانی دولت‌های میر حسین موسوی، وزیر در دولت‌های اول و دوم اکبر هاشمی رفسنجانی و همچنین وزیر کشاورزی در ۳ سال اول دولت اول محمد خاتمی، دوران مسئولیت وزارت کشاورزی اوست. او پس از ادغام دو وزارتخانه کشاورزی و جهاد سازندگی و از سال ۱۳۸۱ با تشکیل خانه کشاورز به عنوان یک تشکل صنفی-سیاسی بخش کشاورزی، دبیرکل آن شده و تاکنون در این سمت فعالیت می‌کند. همچنین در بهمن ۱۳۹۲، حمید چیت‌چیان وزیر نیروی دولت یازدهم، اعلام کرد که ستاد احیای دریاچه ارومیه به دبیری عیسی کلانتری تشکیل شده‌است.